Từ ngày 14/11/2016, phương tiện 12 chỗ hoạt động trên tuyến xe buýt có trợ giá số 46: Cảng Quận 4 – Bến Mễ Cốc được thay thế bằng xe mới 40 chỗ, lộ trình tuyến cũng được điều chỉnh, giá vé giảm còn 5.000 đ/lượt hành khách.
Lộ trình và các thông số hoạt động trên tuyến:
1. Lộ trình:
- Lượt đi: Bến xe Cảng Quận 4 (dưới chân cầu Kênh Tẻ) - Tôn Thất Thuyết -Nguyễn Khoái - Bến Vân Đồn - Khánh Hội - Hoàng Diệu - cầu Ông Lãnh - Nguyễn Thái Học - Lê Thị Hồng Gấm - Yersin - Phạm Ngũ Lão - Nguyễn Thị Nghĩa - vòng xoay Phù Đổng - Nguyễn Trãi - Nguyễn Biểu - cầu Chữ Y - Hưng Phú - Xóm Củi - Đường vòng Chân cầu Chà Và - Đình Hòa - Cao Xuân Dục - Tùng Thiện Vương-Tuy Lý Vương-Nguyễn Chế Nghĩa - Bến Bình Đông - Bến Mễ Cốc - cầu số 3 - Mễ Cốc - (quay đầu tại chân cầu số 3) - đường vòng chân cầu số 3 - Lưu Hữu Phước -Chợ Rạch Cát;
- Lượt về: Chợ Rạch Cát - Lưu Hữu Phước-Đường vòng chân cầu số 3 - Mễ Cốc- (quay đầu tại chân cầu số 3) - cầu số 3 - Bến Mễ Cốc - Bến Bình Đông - Nguyễn Chế Nghĩa - Tuy Lý Vương - Tùng Thiện Vương-Xóm Củi - Hưng Phú - cầu Chữ Y - Dạ Nam - Phạm Thế Hiển - Dạ Nam - cầu Chữ Y - Nguyễn Biểu - Nguyễn Trãi - Lê Lai - (vòng xoay Chợ Bến Thành) - Trần Hưng Đạo – Phạm Ngũ Lão - Nguyễn Thị Nghĩa - Nguyễn Thái Học - cầu Ông Lãnh - Khánh Hội - Bến Vân Đồn - Nguyễn Khoái-Tôn Thất Thuyết - Bến Cảng Quận 4 (dưới chân cầu Kênh Tẻ).
Cự ly: Giảm từ 18,45 km thành 16,75 km.
2. Các thông số hoạt động khác: Không thay đổi.
- Số chuyến: 120 chuyến/ngày.
- Thời gian hoạt động trong ngày:
+ Chuyến đầ tiên xuất bến: 05 giờ 00 phút.
+ Chuyến cuối cùng xuất bến: 18 giờ 45 phút.
- Thời gian hành trình: 65 phút/chuyến.
- Thời gian giãn cách: 12-15 phút/chuyến.
- Loại xe: County Limousine 40 chỗ (có máy lạnh).
3. Giá vé: Giảm từ 6.000 đồng/lượt hành khách thành 5.000 đồng/lượt hành khách.
a) Vé lượt: Áp dụng cho hành khách thường: giá vé đồng hạng 5.000 đồng/lượt hành khách; Áp dụng cho đối tượng học sinh, sinh viên: Giá vé lượt đồng hạng: 2.000 đồng/lượt hành khách.
b) Vé bán trước (hay vé tập năm): Tương ứng với giá vé lượt 5.000 đồng/lượt hành khách: Giá vé tập năm là 112.500 đồng/1 tập 30 vé.